舌鳞癌是口腔癌中发病率最高的恶性肿瘤,55岁左右的人群为舌鳞癌高发群体,但近年来逐渐呈现年轻化的趋势[1,2]。目前已知多种因素均能导致舌鳞癌的产生,但具体发生机制尚不明确[3]。寻找新的关键基因或标志物利于舌鳞癌的深入认识,也有助于舌鳞癌的早期诊断、靶向治疗以及改善患者预后[4,5]。
Long non-coding RNA(lncRNA)是长度大于200 nt一类非编码RNA,其作用广泛,机制复杂。近年来研究发现lncRNA可以参与多种生物学功能,同时也是癌症相关的重要调控因子[6,7]。长非编码RNA PANDAR是定位于人类第6号染色体上的一种非编码RNA,其长度约为1500 bp,研究发现它与p53存在相互作用,能够调控多种凋亡相关蛋白的表达[8,9]。BAX(Bcl-2 associated X protein,BAX)基因属于Bcl-2家族成员,广泛表达于多种组织,能够促进细胞凋亡[10,11]。已有研究发现BAX与多种恶性肿瘤的发生发展相关,包括肝癌,乳腺癌等[12,13]。目前尚未见到PANDAR与舌鳞癌的相关研究。本研究将探讨PANDAR在舌鳞癌中的表达及生物学功能,并检测PANDAR与BAX在舌鳞癌中的关系。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 临床样本及细胞系 收集东莞东华医院口腔科及中山大学孙逸仙纪念医院口腔颌面外科2016年2月至2018年5月手术切除的舌鳞癌及其癌旁组织共51例,所有舌鳞癌病例均有病理学诊断证实,其中男 27例,女24例,年龄(54.6±9.5)岁。所有患者均已被告知并签署由本院伦理委员会批准的知情同意书。口腔癌细胞系Cal27,SCC9,SCC25,HSC3,HSC6和HOK购自中国科学院细胞库(上海)。
1.1.2 试剂 Lipofectamine 3000购买于美国Invitrogen公司;PrimeScriptTM RT reagent Kit购买自日本TAKARA公司;Bax抗体购买自CST公司,GAPDH抗体购自Proteintech公司购买。si-NC序列为:GTAGTGAGATGCAGATGATAA,siRPANDAR#1序列为 GCAATCTACAACCTGTCTT,siRPANDAR#2序列为TTTCGAACGGAACAGAGACUUAUACAGATT,由广州锐博生物有限公司合成。RPANDAR qRTPCR上游引物序列为CTGTTAAGGTGGTGGCATTG,RPANDAR下游引物序列为GGAGGCTCATACTGGCTGAT。
1.2 实验方法
1.2.1 细胞培养 Cal27,HSC3,HSC6和HOK细胞用含10%FBS(Gibico)的DMEM培养基培养。SCC9和SCC25细胞用含10%FBS(Gibico)的DMEM/F12培养基培养。放置于37℃,5%CO2的培养箱中,取生长对数期细胞进行实验。
1.2.2 RNA提取及qRT-PCR TRIZOL法提取组织及细胞中的总RNA,PrimeScriptTM RT reagent Kit反转为相应的cDNA。按照SYBR Green PCRMaster Mix的说明书,以cDNA为模板进行qRT-PCR检测,以GAPDH为内参进行表达量的计算。
1.2.3 siRNA的转染 取对数生长期的舌鳞癌细胞接种于6孔板中,至细胞融合度达到70%左右时,按照Lipofectamine 3000的说明书对转染适量的siRNA及相应的对照siRNA。转染6~8小时后更换新鲜培养基,并于转染的48小时后收集细胞沉淀。
1.2.4 CCK8检测 将转染PANDAR siRNA及对照siRNA后的Cal27和SCC25细胞消化并接种于96孔板,放置与37℃,5%CO2的培养箱中培养。之后在 24 h,48 h,72 h每孔分别加入 10μL的CCK-8,利用酶标仪450 nm检测相应OD值,并绘制增殖曲线。
1.2.5 细胞凋亡检测 收集转染48小时后的细胞,按照Annexin V-FITC Apoptosis Staining/Detection试剂盒的说明书(美仑生物),对细胞进行标记,并利用流式细胞分析仪进行检测。
1.2.6 蛋白质印迹法(Western blot) 收集细胞沉淀,用含有蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液裂解细胞。离心收集上清,加入5×loading buffer,100℃煮5分钟。准备SDS-PAGE胶,取适量样品上样。80 V恒压30分钟,120 V恒压1小时,进行转膜。封闭1小时后,分别使用Bax和GAPDH一抗4℃过夜。TBST洗膜3次后,孵育二抗1小时。TBST洗膜3次后,加入ECL发光液进行曝光。
1.2.7 统计学分析 采用GraphPad Prism 7软件进行分析,qRT-PCR和细胞增殖及凋亡率的差异显著性用的是Student t检验进行统计。P值小于0.05则认为差异显著,*表示 P<0.05,**表示 P<0.01,***表示P<0.001。
2 结 果
2.1 PANDAR在舌鳞癌组织及细胞中高表达
我们在51例舌鳞癌及其癌旁正常组本中检测PANDAR的表达水平,与癌旁组织相比PANDAR在舌鳞癌的表达显著升高(P<0.05)(图1A)。此外,与永生化的正常口腔上皮细胞株HOK相比,PANDAR在多数舌鳞癌细胞株内表达上调,其中Cal27和SCC25细胞上调最为显著(图1B)。
2.2 敲低PANDAR抑制舌鳞癌细胞增殖
我们分别转染PANDAR-specific siRNA及对照NC-specific siRNA到Cal27及SCC25中,48小时后收集细胞。利用qRT-PCR检测PANDAR-specific siRNA的敲低效率,验证siRNA的效果,结果发现两条siRNA在两种细胞系中均有良好的敲低效率(图2A)。我们进一步研究敲低PANDAR表达对舌鳞癌增殖的影响。我们分别选取转染后24小时,48小时,72小时的Cal27及SCC25细胞,利用CCK-8试剂盒检测450 nm下的OD值,并绘制相应曲线(图2B)。结果发现,在两种细胞中,敲低PANDAR的表达均能够有效抑制舌鳞癌细胞的增殖。
2.3 敲低PANDAR促进舌鳞癌细胞凋亡
在明确了PANDAR能够有效促进舌鳞癌增殖的基础上,我们进一步使用Annexin V-FITCApoptosis Staining/Detection试剂盒检测PANDAR对舌鳞癌细胞凋亡的作用。将PANDAR-specific siRNA及对照NC-siRNA转染至Cal27及SCC25细胞48小时后,收集细胞进行Annexin V-FITC染色并利用流式细胞仪对PANDAR敲低前后舌鳞癌细胞的凋亡水平进行检测。结果发现在两种舌鳞癌细胞中,敲低PANDAR能够显著促进舌鳞癌细胞的凋亡(图3A和B)。
2.4 PANDAR对凋亡相关蛋白的影响
有研究发现PANDAR与p53存在相互作用,并能影响 Bcl-2 家族凋亡相关基因的表达[14,15]。由此,我们推测在舌鳞癌中,PANDAR可能影响了p53相关通路及Bcl-2家族相关蛋白。为了验证这种设想,我们分别向Cal27及SCC25中转染PANDAR-specific siRNA及对照NC-siRNA,48小时后收集细胞,分别检测BAX,PUMA,NOXA和BID的mRNA及相应蛋白的表达水平(图4A-D)。结果发现敲低PANDAR后,促凋亡基因BAX的mRNA及蛋白的表达水平均发生了明显的上调(P<0.05)。
3 讨论
近年来,大量研究发现lncRNA广泛参与调控细胞的多种生物功能,包括细胞分化,细胞增殖,细胞凋亡等,其中与肿瘤的相关性也不断被揭示[16,17]。虽然 UCA1、MEG3 和 MALAT1 已被证实参与舌鳞癌的进展[18-20],但是仍未能完全揭示lncRNA对舌鳞癌发生发展的调控作用。
在前期研究中,我们收集舌鳞癌及癌旁组织进行lncRNA表达谱分析,并鉴定出了一批在舌鳞癌组织内显著高表达的lncRNA[21],其中PANDAR在舌鳞癌组织内显著高表达其排名靠前,而目前没有关于PANDAR与口腔癌的相关报道。PANDAR定位于人类第6号染色体上,长约1500 bp,在DNA损伤的情况下可以参与p53通路介导凋亡作用,并能够调控部分凋亡相关蛋白[14]。同时,已有研究证实PANDAR与肝癌、胃癌的肿瘤生物学行为密切相关[8,14,22]。本课题对 PANDAR 在舌鳞癌中的表达及功能进行初步研究。首先,我们在51例舌鳞癌及其癌旁组织和舌鳞癌细胞株中检测了PANDAR的表达,PANDAR在舌鳞癌组织和大部分舌鳞癌细胞株内中显著高表达,其中Cal27及SCC25中PANDAR的表达最为突出。因此,我们利用舌鳞癌细胞系Cal27及SCC25研究了PANDAR对舌鳞癌细胞的增殖与凋亡的影响。功能研究显示,在舌鳞癌细胞中转染PANDAR-siRNA和NC-siRNA后Cal27和SCC25细胞的增殖能力被有效抑制,且舌鳞癌细胞的凋亡显著增加。有研究证实PANDAR与p53介导的凋亡通路密切相关,而p53通路能够调控Bcl-2家族的多种凋亡相关基因的表达[8]。因此,我们推测PANDAR可能是通过p53通路调控Bcl-2家族凋亡相关蛋白的表达,继而影响了舌鳞癌细胞的增殖与凋亡。随后,我们检测了p53下游的凋亡相关基因的表达,包括BAX、PUMA、NOXA、BID[23]。结果显示,沉默PANDAR后促凋亡基因BAX的mRNA水平和蛋白水平都发生了明显的上调,说明PANDAR是通过抑制p53下游的促凋亡基因BAX的表达,进而促进舌鳞癌细胞的增殖并抑制其凋亡。
目前已有研究证实在PANDAR在瘤内的高表达往往与患者的不良预后成密切相关[14,15,24],我们将在之后的研究中收集更多的舌鳞癌样本检测PANDAR的表达,分析PANDAR的表达与舌鳞癌患者临床病理特征及预后的关系。lncRNAs可以通过改变染色体构象,维持mRNA稳定性,调控靶基因转录,参与蛋白质翻译后修饰等在转录水平上调控下游靶基因[25,26]。PANDAR 有可能采用上述一种方式调控BAX的表达,我们将在后续实验中通过ChIRP-seq实验,研究与PANDAR有结合的DNA;或通过RNA pulldown实验,研究与PANDAR结合的蛋白。
综上所述,PANDAR在舌鳞癌组织及细胞内显著高表达,敲低PANDAR后抑制促凋亡基因BAX在mRNA和蛋白水平的表达,进而抑制了舌鳞癌细胞的增殖,并促进其凋亡。
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