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Lingnan Modern Clinics in Surgery ›› 2018, Vol. 18 ›› Issue (03): 265-268.DOI: 10.3969/j.issn.1009-976X.2018.03.006

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LIANG Jiahong,XU Qiaodong,YAN Jiang   

  1. Department of Biliary-Pancreatic Minimally Invasive Surgery,The First Affiliated Hospital of Shantou University Medical College,Shantou 515041,China
  • Contact: YAN Jiang

结直肠癌中FAM135B 基因的表达及功能的生物信息学分析

梁家宏, 许侨东, 严江*   

  1. 汕头大学医学院第一附属医院
  • 通讯作者: 严江

摘要: [摘要] 目的 通过生物信息学分析研究结直肠癌与正常结肠粘膜间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测参与结直肠癌发生发展中的关键基因。方法 从 GEO 表达谱数据库中下载表达谱基因芯片数据 GSE50760(包括 18 例结直肠癌样本及配对的正常结肠粘膜组织)。利用 Morpheus 在线软件对基因芯片 GSE50760 的数据进行分析,获得在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中差异表达的基因,并构建聚类分析热图。利用 human protein atlas 在线数据库获得差异表达基因在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中的免疫组化表达水平。并进一步利用human protein atlas 数据库的数据对差异表达基因在结直肠癌患者中的表达高低进行生存分析。结果 通过分析 GSE50760 获得前 100 个差异表达的基因。利用human protein atlas 在线数据库对这 100 个差异表达基因的免疫组织表达水平进行分析发现,FAM135B 基因在结直肠癌组织中的表达比正常结肠粘膜中的表达明显下调。生存分析也提示当 FAM135B 基因高表达时,结直肠癌患者的预后相对较好。结论 FAM135B 可能是结直肠癌中潜在的抑癌基因,其表达下调在结直肠癌的发生发展过程发挥重要作用,并可能成为判断结直肠癌患者预后的重要的生物学指标。

关键词: 免疫组化, 生物信息学分析, 预后, FAM135B, 结直肠癌

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